1985年率先指挥中央音乐学院青年民族乐团在北京推出民族音乐现代作品音乐会，首开民族乐队演奏现代作品之先河。曾指挥演奏了谭盾、瞿小松、何训田等中国著名作曲家的交响乐作品音乐会，并与中央民族乐团、广播民族乐团等乐团合作，演出了许多极富挑战的现代作品音乐会；2001年8月应邀到香港指挥香港中乐团演出专场音乐会《天人》获很大成功；2005年初又应邀指挥新加坡华乐团演奏了作曲家郭文景创作的竹笛协奏曲《愁空山》获得好评；同年率团赴上海演出亦获得广泛赞誉。

同时王甫建亦有许多各种类型的音乐创作，如双琵琶协奏曲《断桥》、拉弦与弹拨乐《西江月》、古琴与乐队《听雪》等，其中应香港中乐团委约创作了三弦与乐队《土风四首》，琵琶与乐队《海青拿天鹅》；应台北市立国乐团委约编写了琵琶协奏曲《天祭》。

在2006/2007及2007/2008音乐季中，王甫建策划、推出了一系列主题性、风格性的大型民族交响音乐会。其中《上海回响》和《锦绣中华》两台音乐会被选为上海市重大文艺创作项目。